MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL6A

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017460	AAG	2	6	60	65	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017460	TC	3	6	176	181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017460	GAC	2	6	185	190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017460	GTCA	2	8	209	216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017460	GTC	2	6	267	272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017460	GAGT	2	8	339	346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017460	CGA	2	6	2991	2996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017460	TCG	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017460	GTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017460	AC	3	6	3193	3198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017460	TGT	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017460	TGAC	2	8	3337	3344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017460	AAG	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017460	GAG	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017460	GAC	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017460	AATC	2	8	3636	3643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017460	GT	4	8	3983	3990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017460	CGG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017460	TGCGTA	2	12	5668	5679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017460	CATA	2	8	6061	6068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017460	ACTG	2	8	6100	6107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.